Die zwei wichtigsten Krankheiten der Walnussbäume in der Schweiz sind die Blattfleckenkrankheit der Walnuss, verursacht durch den Pilz Ophiognomonia leptostyla, und die Bakteriose der Walnuss, verursacht durch das Bakterium Xanthomonas arboricola pv. juglandis. Aufgrund ähnlicher Symptome ist eine Unterscheidung dieser beiden Krankheiten oftmals schwierig.