La variabilité génétique du champignon responsable de l’eutypiose, Eutypa lata, s’est révélée très élevée sur la base du séquençage du marqueur moléculaire spécifique ITS de 89 isolats fongiques, provenant d’une parcelle de Chasselas à Perroy (VD). Treize génotypes ITS ont été obtenus, dont trois ne sont pas affiliés à E. lata au sens strict d’après leur emplacement dans une analyse phylogénétique ITS représentative des Diatrypaceae. Cette analyse indique aussi que certains de ces génotypes sont exclusivement associés à des plantes saines ou à des plantes malades alors que d’autres s’associent indifféremment à tous les types de plantes étudiés. Ces résultats suggèrent que seules les souches d’E. lata dont le génotype ne s’associe qu’à des plantes malades sont responsable de l’eutypiose. Une caractérisation moléculaire plus poussée des isolats, par séquençage et analyse combinée de plusieurs gènes, ainsi que des tests de virulence sont nécessaires pour mieux comprendre la signification épidémiologique de la variabilité génétique d’E. lata.