En 2025, Agroscope a réalisé 328 inspections dans les entreprises ainsi que l'analyse de 982 échantillons d'aliments pour animaux de rente et 99 échantillons d'aliments pour animaux de compagnie. Pour les aliments destinés aux animaux de rente, le taux de conformité s'est élevé à 72,9 %. Les non-conformités graves (2,4 %) sont restées peu fréquentes et concernaient principalement des contaminations microbiologiques, des dépassements de teneurs maximales autorisées et un résidu d'emballage. Les contrôles des aliments pour animaux de compagnie ont mis en évidence plusieurs cas de contamination par du colza génétiquement modifié dans des mélanges de graines pour oiseaux ainsi qu'un dépassement de la teneur maximale en ambroisie. Les inspections en entreprise montrent que les principales lacunes concernent les systèmes de gestion de la qualité, notamment les procédures HACCP, la documentation et les procédures de rappel des produits. En parallèle des activités de contrôle, Agroscope a préparé la mise en œuvre des nouvelles tâches découlant de la révision de l'Ordonnance sur les sous-produits animaux (OSPA) et a poursuivi sa collaboration avec les autorités suisses et étrangères.