Christian Ahrens

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Bioinformatiker
Dr.

Forschungsgruppe

  • 22.00.13.10 Molekulare Ökologie

Organisatorische Einheit

Kompetenzbereich Methodenentwicklung und Analytik (MEA)

Christian Ahrens

Agroscope
Reckenholzstrasse 191
8046 Zürich
Schweiz

Tel. +41 58 460 61 14

Standort Reckenholz

Christian Ahrens

Projekte

  • 22.08.13.10.01 Molekulare mikrobielle Ökologie in landwirtschaftlichen Systemen
  • 22.08.13.10.02 Bioinformatikmethoden zur Nutzung funktionell relevanter Mikrobiomisolate
  • 22.05.16.04.01 Entwicklung von neuen biobasierten Molekülen als Alternativen zu Pestiziden
  • 22.08.18.03.05 Mikrobiome der Käseschmiere, der Käse und der Alpkäsereien
  • 22.09.18.07.02 Verbesserung der Eutergesundheit
  • 22.09.18.09.01 Mikrobielle Schutzkulturen in der Agro-Food-Kette
  • 22.15.19.05.01 Nachhaltige Agrarökosysteme durch Nutzung des Bodenlebens

Christian Ahrens

Tätigkeiten

Analyse von Mikrobiomen und funktionell besonders relevanter Isolate unter dem Leitsatz «Vom Genom zur Funktion»

Portfolio: Bioinformatische Analyse und Integration von Daten die mittels Methoden der funktionellen Genomik (zB Genomsequenzierung, Transkriptom-, Proteom-, Metabolomanalysen) erhoben wurden; Einbezug der vergleichenden Genomik. Mitarbeit in nationalen und internationalen Konsortien (u.a. bei der Kompostmikrobiomanalyse; Identifizierung und Charakterisierung von Biocontrolstämmen zur Reduktion Einsatz Pflanzenschutzmittel sowie Förderung Pflanzenwachstum). Synergie mit Drittmittelforschung: Entwicklung integrierter Systeme zur Erforschung von Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung; Entwicklung von Methoden zu verbesserten Genomannotation von Prokaryoten; Identifizierung neuer Biokontrollgene und antimikrobiell wirkender Peptide.

Thematischer Fokus: Prokaryoten, Biokontrolle, Plant growth promotion, Interaktion Pflanzen-Mikroorganismen, fermentierte Lebensmittel, Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung

Methodischer Fokus: Assemblierung von Genomen (de novo), Synergie Genomik -Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, intergierte Datenanalyse, Entschlüsselung von Wirkmechanismen

Publikationsverzeichnisse

  1. Publons
  2. ResearchGate
  3. Google Scholar