La PCR nichée et la PCR en temps réel sont des techniques utilisées en routine pour diagnostiquer les phytoplasmoses en arboriculture fruitière. La première méthode, utilisée dans le laboratoire de phytoplasmologie d’Agroscope, à Changins, a été comparée à la deuxième sur cent seize pommiers, poiriers et abricotiers. Le test montre que la PCR en temps réel est un peu plus précise. Cette faible différence peut cependant avoir un impact important dans la production de matériel végétal arboricole certifié. Cependant, le facteur d’imprécision le plus déterminant se révèle lié au mode d’échantillonnage choisi.