Les souches microbiennes qu’Agroscope utilise pour les essais dans la pratique et qui, si les essais sont concluants, feront ensuite partie d’une culture mixte définie, doivent présenter un niveau élevé de sécurité. L’analyse de 164 souches de bactéries lactiques de la collection de souches d’Agroscope a permis d’évaluer leur innocuité en termes de résistance aux antibiotiques transmissible, de formation d’amines biogènes et de présence de facteurs de virulence. Seules six souches ont dû être exclues, car elles présentaient une ou plusieurs résistances aux antibiotiques transmissibles. Ces souches ont été isolées il y a seulement quelques années. La plupart des souches de la collection d’Agroscope ont été isolées il y a plusieurs décennies, à une époque où les résistances ne s’étaient pas encore propagées. Outre l’âge élevé de la plupart des isolats, leur grande biodiversité et leur grand nombre confèrent à la collection de souches d’Agroscope une valeur inestimable.