L'application de taches noires sur la variété de poire -Empereur Alexandre- causé de gros soucis à partir de 1995. Ces taches ne sont pas le fait d'un agent pathogène (champignon ou bactérie). Les coupables ont en effet été identifiés: il s'agit de la combinaison d'un type de poire Empereur Alexandre à peau plus claire et de certaines caractéristiques du sol (sols lourds, humides, pauvre en humus). Depuis 2002, le type de fruit incriminé n'a plus été multiplié. 120 sujets issus desconservatoires d'Agroscope et Stuttgart et plantés dans deux exploitations productrices sur des parcelles où le problème des -taches noires- avait apparu ont donné des fruits à peau plus foncée, ponctuée de la rouille typique de cette variété, mais sans taches noires. L'utilisation de matériel de multiplication certifié issu de jardin d'étalon P2 ayant pour base des sujets de conservatoire permet d'éradiquer ce problème.
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