Project number: 22.08.18.03.05

The microbiomes of cheese, its smear and alpine cheese dairies

En collaboration étroite avec la branche fromagère, de nouvelles données seront générées par la caractérisation d’écosystèmes d’intérêt, allant de la morge, ce biofilm de microorganismes qui couvre une grande partie des fromages suisse, jusqu’à l’étude de la biodiversité dans les fromageries d’alpages. Un focus sera mis sur une sélection de bactéries influençant la qualité du fromage par la production de vitamines, d’arômes, de pigments, ou encore celles responsables de défauts. Il s’agira de quantifier leur présence dans le fromage, de reproduire leurs caractéristiques par une inoculation ciblée de fromages d’essais, et d’investiguer les voies métaboliques utilisées par ces bactéries grâce à des outils de biologie moléculaires et biochimiques de dernière génération.

Last Name, First Name Location
Aeschlimann Thomas Liebefeld
Ahrens Christian Reckenholz
Arias Emmanuelle Marie Liebefeld
Bär Cornelia Liebefeld
Berthoud-dit-Gallon Marchand Hélène Liebefeld
Egger Charlotte Liebefeld
Irmler Stefan Liebefeld
Schmidt Remo Liebefeld

Schmidt R.
Beprobung Berner Alpen: Ergebnisse der Beprobung 2021.
In: Beratertagung Deutschschweiz. 11. November, Publ. Agroscope, Liebefeld (CH). 2025.

Arias E. M., Carlavero-Fita J., Roetschi A.
Influence of smear microbiota on the survival of Escherichia coli in raw milk cheeses.
In: 1st International Conference on Fermented Foods. 26 October, Publ. NOI TECHPARK SÜDTIROL, Bolzano (IT). 2025.

Schmidt R., Feller M.
Der Charakter des Berner Alpkäse AOP.
CasAlpLine, 2, 2025, 16.

Schmidt R., Feller M.
Der Charakter des Berner Alpkäses.
Montagna, 35, (6), 2025, 10-11.

Schmidt R., Somerville V., Berthoud-dit-Gallon Marchand H., Guggenbühl B., Gschwend F., Arias E.
The sensory and microbial diversity of Bernese Alp Cheese.
In: 13th FACEnetwork Meeting. 11. October, Grangeneuve (CH). 2023.

Irmler S., Bavanantharajah T., Binz E., Portmann R.
Ability of Latilactobacillus curvatus FAM25164 to produce tryptamine: Identification of a novel tryptophan decarboxylase.
Food Microbiology, 116, 2023, 1-8.

Wenger A., Bär C., Portmann R., Schmidt R. S., Eugster E., Weisskopf L., Irmler S.
The aminotransferase Aat initiates 3-phenyllactic acid biosynthesis in Pediococcus acidilactici.
Frontiers in Microbiology, 14, 2023, 1-10.

Somerville V., Showing T., Chabas H., Schmidt R., Von Ah U., Bruggmann R., Engel P.
Extensive diversity and rapid turnover of phage defense repertoires in cheese-associated bacterial communities.
Microbiome, 10, 2022, Article 37.

Somerville V., Von Ah U., Schmidt R., Engel P.
Genomic signatures of domestication in bacterial communities of Swiss cheese starter cultures.
In: ASM Microbe. 08. Juni, Washington DC. 2022.

Somerville V., Grigaitis P., Battjes J., Moro F., Teusink B.
Use and limitations of genome-scale metabolic models in food microbiology.
Current Opinion in Food Science, 43, 2022, 225-231.

Somerville V., Schowing T., Chabas H., Schmidt R., Von Ah U., Bruggmann R., Engel P.
Extensive diversity and rapid turnover of phage defense repertoires in cheese-associated bacterial communities.
In: CRISPR 2022. 12. Juni, Boston. 2022.

Somerville V., Berthoud-dit-Gallon Marchand H., Schmidt R., Bachmann H.-P., Meng Y. H., Fuchsmann P., Von Ah U., Engel P.
Functional strain redundancy and phage resistance diversity in Swiss raw mixed cultures.
In: CBL 2022. 08. Juni, Publ. INRA Frankreich, Rennes. 2022.

Schmidt R.
Beprobung Berner Alpen: Erste Ergebnisse der Beprobung 2021.
In: Netzwerkanlass Alpwirtschaft. 07. April, Publ. Inforama Berner Oberland (Hondrich), Inforama Berner Oberland (Hondrich). 2022, 1-24.

Berthoud H., Wechsler D., Irmler S.
Production of putrescine and cadaverine by Paucilactobacillus wasatchensis.
Frontiers in Microbiology, 13, 2022, 1-10.

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